В 1939 году молодого человека призывают на службу во флот. В начале Великой Отечественной войны черноморец Головкин участвовал в обороне Севастополя и Одессы. К 1943 году пути войны закинули его далеко от побережья – в разведроту 253-й стрелковой дивизии 40-й армии Воронежского (впоследствии 1-го Украинского) фронта.
25 сентября 1943 года морпех Головкин с группой разведчиков форсировал Днепр. В районе поселка Дымер завязался бой, который продолжался несколько часов.
Вот как описывала эти события газета «Пролетарская правда» за 1946 год: «Первым бросился в воду Алексей Головкин. За ним последовали еще 12 бойцов. Переплыв широкую реку, они зацепились за правый берег и будто вросли в землю. На 13 человек немцы бросили роту автоматчиков. Они поливали советских смельчаков ливнем свинца, забрасывали минами. Бой продолжался до обеда. В нашей группе оставалось всего четыре человека. Но горстка советских бойцов мужественно удерживала захваченный рубеж. Когда на помощь им пришли наши бойцы, Алексей лежал в луже крови. С него осторожно сняли изорванную шинель. Из кармана выпала черная ленточка с бескозырки, на которой горели гордые слова — "Черноморский флот"».
За этот подвиг в октябре 43-го Алексей Головкин был удостоен звания Героя Советского Союза.
После тяжелого ранения в строй он уже не вернулся. Зато, несмотря на инвалидность, вернулся в море: сначала ходил матросом, а к 1955 году окончил мореходное училище и стал капитаном дальнего плавания. На кораблях Ленинградского пароходства прошел не одну тысячу морских миль.
Алексей Головкин прожил 64 года. Его не стало 27 декабря 1983 года. Похоронен герой на кладбище Памяти жертв 9-го января в Санкт-Петербурге. За его могилой ухаживают ученики гимназии №171 и школы №300.
