Демонстрируя предрасположенность к учебе, Яков окончил три класса церковно-приходской школы в селе Пушья Слободского уезда, получив при этом медаль «300 лет Дома Романовых» за ученические успехи. А уже в 12 лет (как и многие его сверстники) стал батраком. Вероятно, такая судьба была уготована Падерину, но спустя четыре года грянула революция, и эти перемены вынесли его на иной жизненный путь. Сначала он был выбран секретарем в комитете бедноты, отсюда пошел в Кировский финансовый техникум, а затем возглавил районное финансовое отделение. До войны успел побыть председателем сельсовета и заведующим сберегательной кассой.
В Красную Армию его призвали в сентябре 1941 года. 39-летний Яков Николаевич стыл стрелком 1186-го стрелкового полка 355-я стрелковой дивизии 39-я армии Калининского фронта. Но успел повоевать лишь до 27 декабря 1941 года, за 18 дней до этого встретив свое 40-летие.
Советские войска тогда бились за Калинин и Старицу, бои шли под Торжком. Дивизия наступала на деревню Рябиниху — мощный опорный пункт немцев со множеством блиндажей и дзотов. Роту, в которой был Яков Падерин, направили в обход деревни.
Немцы, открыв огонь из пулемета, заставили стрелков залечь. Падерин подобрался к дзоту и начал забрасывать туда гранаты. Но, когда боеприпасы закончились, а пулемет из дзота продолжал стрелять, он поднялся и закрыл своим телом амбразуру, давая советским солдатам время подойти к немцам. Рябиниха и еще с десяток сел и деревень были освобождены.
Якова Падерина захоронили в братской могиле в Рябинихе Торжокского района, позднее перезахоронили в братской могиле в поселке Завидово Конаковского района Тверской области.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 5 мая 1942 года за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецкими захватчиками и проявленные при этом отвагу и геройство красноармейцу Падерину Якову Николаевичу посмертно присвоено звание Героя Советского Союза. Он также награжден орденом Ленина посмертно.
Деревню Еруны, что неподалеку от Рябинихи, после войны переименовали в Падерино. Именем Якова Падерина названы улицы в Торжке и Кирове.
