В районе пересечения ВСМ с направлением железной дороги «Бологое – Валдай» планируется строительство станции Выползово. Далее по территории Вышневолоцкого района ВСМ следует параллельно автомобильной дороге М-11 с западной стороны на удалении 1,5 – 2 км до реки Цна. На данном участке пути ось трассы пересекает реки Шлина, Лонница, а также природные заказники «Болото Борисовское, Шлинское», «Лесные массивы в междуречье рек Шлина, Крупица, Лонница».
На участке от реки Цна до Торжка ВСМ пересекает реки Лядка, Петриловка, Барановка, Черемница, Садва, Ольховка, Плотиченка, Чертовля, Веревочка, Оскомля, Юрикова канава, Кичка, Осуга, Тверца и автомобильную дорогу М-10 в районе деревни Большая Киселевка, а также памятники археологии «Нарачинский», «Скойковско-Мышлятинский» и отдельный памятник археологии в районе деревни Ям-Григино. Севернее деревни Кривцово планируется размещение станции Садва.
После пересечения автомобильной дороги М-10 «Россия» в районе деревни Большая Киселевка ось трассы примыкает с западной стороны к автомобильной дороге М-11 и следует параллельно ей на удалении 300 – 500 метров до ее соединения с автомобильной дорогой М-10 в районе деревни Романово Калининского района, пересекая по пути реку Логовежь.
В месте пересечения оси ВСМ с существующей железной дорогой по направлению «Торжок – Лихославль» в районе Торжка планируется строительство станции Логовежь. Далее от деревни Романово трасса пересекает реку Тверца, где проходит по территории объекта археологического значения «Селище медное II, XVI-XVIII вв. н.э.» и далее, пересекая автомобильную дорогу М-10 в районе деревни Поддубки, следует по территории Заволжского сельского поселения Калининского района между деревнями Городня и Ширяково в направлении деревни Щербово.
После прохождения деревни Щербово ось трассы пересекает реку Волга по направлению к деревни Рябеево и проходит далее между деревнями Шигалово и Опарино с восточной стороны лесного массива и далее, пересекая Старицкое шоссе, следует прямолинейно, обходя с северо-восточной стороны деревню Даниловское, по направлению к деревне Игнатово. В районе деревни Курово планируется размещение станции Новая Тверь. На участке от деревни Даниловское до деревни Игнатово ось трассы пересекает реки Тьмака и Крапивная, автомобильную дорогу Тверь – Лотошино – Шаховская – Уваровка, а также охранную зону ОКН «Воинское захоронение у д. Аксинькино».
Далее ось трассы проходит между жилой застройкой деревень Игнатово и Обухово, где также попадает в охранную зону ОКН «Воинское захоронение у д. Обухово» и следует южнее деревень Поминово и Осекино в направлении главного хода Октябрьской железной дороги, к которой примыкает с южной стороны в районе д. Кузьминка.
Далее ВСМ следует параллельно существующей железной дороги в удалении 200 – 300 метров и пересекает ее в районе деревни Козлово. После пересечения главного хода Октябрьской железной дороги ось трассы пересекает автомобильную дорогу М-11 и продолжает свое движение восточнее нее на удалении 600 – 900 м.
На подходе к реке Шоша ВСМ максимально приближается к автомобильной дороге М-11 «Нева» – до 150 метров. После перехода через реку Шоша ВСМ располагается в едином коридоре с автомобильной дорогой М-11 – 150 – 200 м, что предусматривает пересечение границ охранной зоны национального парка «Государственный комплекс «Завидово».