С. Чернышев единолично вынес решение, по которому МУП «Вышневолоцкое ПАТП» было дано разрешение на продажу здания автостанции путем проведения торгов в форме аукциона. При этом данное помещение не было включено в прогнозный план приватизации.
В итоге 18 июля 2006 года на состоявшемся аукционе здание автостанции было продано частному лицу. В тот же день был подписан договор купли-продажи. В результате причиненный Чернышевым государству ущерб составил 464 тысячи рублей, которые так и не поступили в городской бюджет.
Прокуратура возбудила против Чернышева уголовное дело и направила иск в городской суд с просьбой расторгнуть договор купли-продажи, признав его незаконным. В мае 2009 года вступило в законную силу решение Вышневолоцкого городского суда, по которому данный договор был признан недействительной сделкой.
Здание автостанции было возвращено в муниципальную собственность города, виновное лицо получило наказание в виде штрафа размером 10 тысяч рублей.